由于壳寡糖分子中含有较多的氨基和羟基，其分子间或分子内作用较强，分离纯化相对较困难。目前，壳寡糖的分离纯化方法主要有：膜分离法、凝胶渗透色谱法、薄层色谱法和离子交换色谱法等。膜分离技术是20世纪60年代后迅速崛起的一门分离新技术。由于该技术兼有分离、浓缩、纯化和精制的功能，又有高效、节能、环保、分子级过滤及过滤过程简单、易于控制等特征，因此，已广泛应用于食品、医药、生物、环保、化工、冶金、能源、石油、水处理、电子、仿生等领域，产生了巨大的经济效益和社会效益，已成为当今分离科学中重要的手段之一。
果蔬在逆境环境和衰老过程中会产生大量的，引起了的积累和浓度的升高，激发植物的抗病系统发生反应。为避免活性氧的过度积累对细胞膜系统的破坏，果蔬体内有一套抗氧化系统以降低活性氧对机体的损害。抗氧化系统包括酶促系统及非酶促系统。其中非酶促系统包括酷类、胡萝卜素等；酶促系统包括过氧化氧酶、过氧化物酶、抗坏血酸氧化酶和超氧化物歧化酶等。当果蔬体内活性氧超出正常水平时，果蔬自身会加强抗氧化相关酶活性的增强，参与活性氧的去除，。在壳寡糖诱导柑橘果实的抗病研究中发现，壳寡糖诱导可显著提高甜橘果皮活性。罗小芬等在研究发现壳聚糖涂膜处理番菊可维持、等保护酶较高的活性。杜县光等和陈喜文等研究发现，壳寡糖处理可导致烟叶片和黄瓜叶片中防御酶活性有的提高。
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